水性聚氨酯材料最大的優勢在于其分子結構的可控性，我們可以根據需要制備不同性能的水性聚氨酯材料。 影響水性聚氨酯材料性能的首要因素是基團的內聚能，基團的內聚能與力學性能和軟化點密切相關，分子結構中基團的內聚能越大，相應材料的力學性能越好。 軟化點越高。 脲基和氨基甲酸酯基的內聚能較高，其次是酯基、羥基、羧基，脂肪烴和醚基的內聚能較低。
影響研究材料進行力學系統性能的另一個主要因素是分子中氫鍵的存在,氫鍵是一種學習物理吸附力,不同于化學鍵形成合力,它的存在能起到一個物理交聯的作用,提高我國水性聚氨酯彈性體的強度及耐磨順性能。結晶性也是社會影響建筑材料使用性能的重要經濟因素,分子利用結構越規整。極性及剛性基團含量越來越多,材料的結晶技術性能也相應能力越好,一般企業來說就是水性聚氨酯復合材料的強度、硬度、耐溶劑性能、軟化點隨著文化結晶程度的增加而增加,而斷裂伸長率和溶解性能則隨結晶程度的增加而降低。
為了獲得綜合性能更好的水性聚氨酯材料，可以在制備過程中加入交聯劑使其適度交聯，從而提高材料的硬度、彈性模量和軟化溫度。交聯劑過量加入時，容易造成材料的斷裂伸長率、溶解性和永久變形急劇下降，所以一定要注意交聯劑的加入量。對于分子量來說，主要會影響線型水性聚氨酯彈性體的性能，但是對于高交聯度的水性聚氨酯泡沫來說，分子量不是影響其性能的主要因素。分子量越高，相應材料的拉伸強度、斷裂伸長率和硬度越高。影響水性聚氨酯材料性能的另一個主要因素是溫度，溫度主要影響鏈段的規整性。同時，高溫容易使線性分子鏈支化交聯，低溫更有利于氫鍵的形成。